合肥市第四十六中学于1946年建校，前身为合肥市万慈小学，金寨路小学，1975年为现名。原校址位于三孝口南端金寨路406号，北望七桂塘，南靠红星路，占地面积6.33亩，校舍建筑面积9800多㎡。2007年7月，遵照合肥市委、市政府决定，原合肥46中与合肥师范附属学校初中部（成立于1999年8月）合并，成立新的合肥市第四十六中学，整建制迁入滨湖新区，隶属于包河区教育体育局，成为合肥市第一所全日制寄宿制公办初中。确立了打造省内一流、全国知名的名牌特色初中的奋斗目标。